当社でもかつて、OSXと複数台のネットワークプリンタ環境で同様の現象が発生して難儀したことがあります。レーザープリンタに出したはずなのにインクジェットで出たり、もうむちゃくちゃでしたが、常に一時的に発生して追い始めると正常動作に戻っているので再現が出来ず、でもちょこちょこ起きるとい う……。一時停止もたびたび起きていました。
ただ、OSのバージョンアップ、Illustratorのバージョンアップ、ネットワーク構成、プリンタ機器構成の変更などを経て再発しなくなってしまったため、結局は何が原因を追い切れてい ません。CS5かCS6の頃で、OSは10.6〜10.9ぐらいの混在でした。プリンタが時々データを受け付けなくなることがあり、ネットワークケーブルの抜き差しで復帰したりしていたので、 何か当時のネットワークに根本的に問題があったのかもしれません。
あまりお役に立てず申し訳ありません。